
Recepção: 09-06-2026
Aprovação: 15-07-2026
pág. 2856
DOI: https://doi.org/10.61616/rvdc.v7i2.1711
GeneXPERT para pruebas de tuberculosis y resistencia a la
rifampicina en pacientes atendidos en el Centro de Salud Jipijapa
Jorman Armando Monroy Magallan
monroy-jorman@unesum.edu.ec
https://orcid.org/0009-0003-9416-9105
Universidad Estatal del Sur de ManabÃ
Ecuador, Jipijapa
Anthony Xavier Reyes Barrera
reyes-anthony7273@unesum.edu.ec
https://orcid.org/0009-0009-3809-929X
Universidad Estatal del Sur de ManabÃ
Ecuador, Jipijapa
Gilson Alfonso Hidalgo Villavicencio
gilson-hidalgo@unesum.edu.ec
https://orcid.org/0000-0003-3364-7700
Universidad Estatal del Sur de ManabÃ
Ecuador, Jipijapa
RESUMEN
La tuberculosis continúa siendo una de las principales enfermedades infecciosas de impacto
en la salud pública, especialmente en paÃses de ingresos medios y bajos, donde persisten
dificultades para el diagnóstico oportuno y el control de la resistencia farmacológica. En este
contexto, la prueba molecular GeneXpert MTB/RIF se ha consolidado como una herramienta
clave para la detección rápida de Mycobacterium tuberculosis y de resistencia a la rifampicina.
El objetivo de la investigación fue analizar GeneXPERT para pruebas de tuberculosis y
resistencia a la rifampicina en pacientes atendidos en el Centro de Salud Jipijapa 2025. La
metodologia de estudio fue observacional, descriptivo, transversal y retrospectivo, que
incluyó a 434 pacientes, seleccionados mediante muestreo censal a partir de registros
institucionales. Los resultados evidenciaron una positividad para tuberculosis del 8,1% (n=35)
y una resistencia a la rifampicina del 2,1% (n=9), registrada exclusivamente en el sexo
masculino. Predominaron los adultos en edad económicamente activa. No se encontró
asociación estadÃsticamente significativa entre edad y sexo con la positividad de la prueba; sin
embargo, descriptivamente se observó mayor frecuencia en hombres. Se concluye que el
GeneXpert es una herramienta diagnóstica eficaz y oportuna, recomendándose fortalecer su
uso y la vigilancia epidemiológica en poblaciones de mayor riesgo.
Palabras clave: Baciloscopia, diagnóstico, epidemiologÃa, farmacorresistencia, sensibilidad
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Este trabajo está bajo una licencia Creative Commons Attribution 4.0 International.

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GeneXpert for tuberculosis testing and rifampicin resistance in
patients treated at the Jipijapa Health Center
ABSTRACT
Tuberculosis remains one of the leading infectious diseases affecting global public health,
particularly in low- and middle-income countries, where challenges persist in achieving early
diagnosis and controlling antimicrobial resistance. In this context, the GeneXpert MTB/RIF
molecular assay has become an essential diagnostic tool for the rapid identification of
*Mycobacterium tuberculosis* and the detection of rifampicin resistance. The objective of
this study was to evaluate GeneXpert testing for tuberculosis and rifampicin resistance among
patients managed at the Jipijapa Health Center during 2025. The methodology consisted of an
observational, descriptive, cross-sectional, retrospective study involving 434 patients selected
through census sampling from institutional clinical records. The findings revealed a
tuberculosis positivity rate of 8.1% (n=35) and rifampicin resistance of 2.1% (n=9), identified
exclusively among male patients. Individuals of economically productive age represented the
predominant population. No statistically significant association was identified between age or
sex and test positivity; however, descriptively, a greater frequency of positive cases was
observed in males. It is concluded that the GeneXpert MTB/RIF assay constitutes an accurate
and timely diagnostic method, and its broader implementation, together with strengthened
epidemiological surveillance, is recommended for populations at increased risk.
Keywords: Bacilloscopy, diagnosis, epidemiology, drug resistance, sensitivity
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INTRODUCCIÓN
La tuberculosis (TB) es una enfermedad infecciosa de transmisión aérea causada por
Mycobacterium tuberculosis, que continúa representando un grave problema de salud pública
mundial debido a su alta incidencia, mortalidad y repercusión social, especialmente en paÃses
de ingresos bajos y medios donde persisten limitaciones en infraestructura sanitaria y acceso
a diagnósticos oportunos. En respuesta a este desafÃo, el sistema molecular GeneXPERT
MTB/RIF se ha convertido en una herramienta esencial, ya que permite detectar de forma
rápida y automatizada la presencia del bacilo tuberculoso y, simultáneamente, identificar la
resistencia a la rifampicina, fármaco fundamental en el tratamiento de primera lÃnea.
Cuando la tuberculosis adquiere resistencia a la rifampicina, surgen complicaciones que
resultan especialmente inquietantes: el proceso de recuperación se alarga de manera
considerable, los costos asociados al tratamiento aumentan drásticamente y la enfermedad
encuentra mayor facilidad para propagarse entre la población. Esto sucede porque el
Mycobacterium tuberculosis consigue multiplicarse a pesar de las dosis terapéuticas correctas
del medicamento, ordinariamente debido a cambios en el gen rpoB, razón por la cual se
considera un marcador fundamental para la vigilancia epidemiológica. El diagnóstico
tradicional de la TB ha sido la baciloscopia y el cultivo, siendo este último el estándar de oro
por su alta sensibilidad.
La Organización Mundial de la Salud (OMS) reportó que durante 2022 aproximadamente 10,6
millones de personas contrajeron tuberculosis (TB) a nivel mundial, con un saldo de alrededor
de 1,3 millones de muertes vinculadas a esta enfermedad. Estas cifras ponen de manifiesto la
urgencia de fortalecer las estrategias orientadas al diagnóstico oportuno, garantizar el acceso
a servicios de salud de calidad y contar con tratamientos adecuados que permitan disminuir
tanto los nuevos casos como la propagación del padecimiento en las comunidades. Por otra

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parte, el informe señala que la mayorÃa de estas cifras se concentran en naciones de ingresos
bajos y medios, donde persisten vacÃos importantes en cuanto a la identificación de casos, el
registro de información y la finalización exitosa del tratamiento en los afectados (Tuberculosis,
n.d.).
Rimal R y col. (Rimal et al., 2022) en Nepal en el año 2022 en su estudio Rendimiento
diagnóstico de GeneXPERT MTB/RIF en la detección de MTB en pacientes presunto de
tuberculosis con citologÃa negativa mediante un método experimental, se obtuvo como
resultado en un análisis de 173 muestras de esputo, el 93,6% fue negativo por baciloscopia.
De esas muestras negativas, el cultivo confirmó TB en el 21,6% y el GeneXPERT MTB/RIF en el
19,1%, identificando que el 80,6% eran sensibles a rifampicina y el 12,9% resistentes. El
sistema mostró sensibilidad del 74,3%, especificidad del 96,6% y una concordancia del 90,91%
con el cultivo (Kappa 0,73), evidenciando su alta utilidad para detectar tuberculosis y
resistencia a rifampicina aun cuando la microscopÃa resulta negativa.
Acosta D y col. (GeneXpert Como Método de Diagnóstico de La Tuberculosis En Santiago de
Cuba, n.d.), en Cuba en el año 2022 en su estudio GeneXPERT como método de diagnóstico
de la tuberculosis en Santiago de Cuba, mediante un estudio descriptivo y transversal en 31
pacientes, se obtuvo como resultado la mayorÃa de los casos correspondió a pacientes
mayores de 50 años (48,4%), predominando el sexo masculino (66,7%), y utilizándose el
esputo como muestra principal (80,6%). El cultivo fue positivo en 32,3% de los casos y el
GeneXPERT en 22,6%, diagnosticándose tuberculosis en 11 pacientes. La concordancia entre
métodos mostró un Ãndice de Kappa de 0,58. Se concluye que el GeneXPERT constituye una
herramienta diagnóstica confiable para la detección de tuberculosis, debido a su alta
sensibilidad y especificidad en comparación con técnicas tradicionales como la baciloscopia y
el cultivo, respaldada por una concordancia significativa.

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Apolo M. (Bravo & Campoverdeo, 2024), en Ecuador en el año 2024 en su estudio
Mycobacterium tuberculosis resistente a Rifampicina en la provincia de El Oro-Ecuador,
mediante un enfoque cuantitativo, de tipo descriptivo y no experimental. Entre 2019 y 2022
se documentaron un total de 48 casos con diagnóstico confirmado de tuberculosis resistente
a rifampicina. El 2022 fue el año que mostró la mayor concentración de casos, concentrando
poco más de un tercio del total de los reportes (33,3%). La población más vulnerable resultó
ser la de hombres adultos jóvenes, especÃficamente aquellos con edades entre los 20 y 49
años.
López J y col. (VizcaÃno et al., 2025), en la provincia de ManabÃ, Ecuador en el año 2025, en su
estudio Eficacia de los métodos de laboratorio para diagnóstico de tuberculosis pulmonar en
pacientes del Centro de Salud tipo C La Maná, 2022- 2024, En un estudio transversal,
retrospectivo y cuantitativo realizado en 80 pacientes mayores de 18 años con sÃntomas
respiratorios compatibles con tuberculosis, se compararon tres métodos diagnósticos:
baciloscopia, cultivo sólido Ogawa–Kudoh como referencia y el ensayo molecular rápido
GeneXPERT MTB/RIF. El GeneXPERT demostró un desempeño notablemente superior al de la
baciloscopia, logrando una sensibilidad de 98%, una especificidad de 77% y una asociación
diagnóstica excepcionalmente robusta (OR=161), lo que ratifica su eficacia para reconocer
casos tuberculosos y detectar la resistencia a rifampicina.
La relevancia de esta investigación estriba en que proporciona información pormenorizada
acerca de la tuberculosis y la farmacorresistencia en la población atendida en el Centro de
Salud Jipijapa, datos que resultan de gran valor para reforzar los sistemas de vigilancia
epidemiológica vigentes y suministrar a los gestores sanitarios fundamentos sólidos en los
cuales respaldar sus decisiones venideras. De igual forma, los resultados generados

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contribuirán al desarrollo del conocimiento en el ámbito académico, a la práctica clÃnica
cotidiana y, en última instancia, al mejoramiento de la calidad de vida en la población.
Planteamiento del problema
La tuberculosis sigue representando un grave problema de salud pública, con consecuencias
severas en términos de morbilidad y mortalidad, particularmente entre los grupos más
vulnerables. En nuestro paÃs, pese a los esfuerzos realizados para mejorar las tácticas de
control y los procesos diagnósticos, existen aún brechas importantes en la identificación de
casos en estadios iniciales y en la atención oportuna de los pacientes, factores que facilitan
tanto la propagación de la enfermedad a nivel comunitario como la emergencia de cepas
resistentes a los medicamentos disponibles.
El Centro de Salud Jipijapa ha notado que llegan más pacientes con sÃntomas que sugieren
tuberculosis en todo el cantón Jipijapa. El problema es que las técnicas tradicionales, como la
baciloscopia y el cultivo, no son del todo fiables porque detectan menos casos de los que
realmente existen y tardan mucho tiempo en entregar resultados. Esto genera un retraso
importante en el inicio del tratamiento, facilita que la enfermedad siga propagándose entre la
población y complica bastante la identificación oportuna de cepas resistentes a la rifampicina.
Frente a esta situación, el sistema GeneXPERT MTB/RIF surge como una opción prometedora,
ya que logra identificar de manera simultánea tanto Mycobacterium tuberculosis como la
resistencia a rifampicina en alrededor de dos horas. Sin embargo, resulta indispensable
analizar cómo se desempeña en el ámbito local y de qué forma puede contribuir a un
diagnóstico más rápido y a optimizar la calidad de la atención médica que se brinda en Jipijapa.
Selfegna S y col. (Selfegna & Alelign, 2022), en EtiopÃa en el año 2022 en su estudio Detección
de Mycobacterium tuberculosis y resistencia a la rifampicina utilizando el ensayo GeneXPERT
MTB/RIF en el Hospital Enat, EtiopÃa Central mediante un estudio transversal entre sus

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resultados se encontró que las probabilidades de que los participantes del estudio VIH
positivos y de retratamiento se infecten por M.tuberculosis fue mucho mayor que la de los
casos VIH negativos y los recién tratados, respectivamente (P < 0,05). Sin embargo, ninguna
de las caracterÃsticas sociodemográficas y clÃnicas del paciente se asoció significativamente
con el desarrollo de la TB-RR (P > 0,05). Los hallazgos, atribuidos a diferentes factores de
riesgo, sugirieron una necesidad urgente de medidas de intervención adecuadas para reducir
la transmisión de la PTB y el desarrollo de resistencia a fármacos antituberculosos en el área
de estudio.
Contreras D y col. (Contreras D & Sánchez M, 2024), llevaron a cabo en México durante 2024
una revisión sistemática acerca de la técnica GeneXPERT MTB/RIF destinada al diagnóstico de
tuberculosis. Los hallazgos demostraron una sensibilidad y especificidad del 97% en casos de
TB pulmonar, a partir de investigaciones que presentaban una calidad aceptable y un bajo
riesgo de sesgos, determinando que GeneXPERT MTB/RIF constituye un instrumento fiable
para la identificación y el diagnóstico clÃnico de tuberculosis.
Formulación del problema
¿Cuál es la utilidad de la prueba GeneXPERT para tuberculosis y resistencia a la rifampicina en
pacientes atendidos en el Centro de Salud Jipijapa 2025?
Definición del objeto de investigación
Este estudio se inscribe dentro del campo de las ciencias de la salud y analiza la tuberculosis
desde una perspectiva epidemiológica y clÃnica, particularmente considerando la emergencia
de cepas con resistencia antimicrobiana. También pretende determinar qué tan útil resulta el
GeneXPERT como instrumento de diagnóstico para detectar tuberculosis e identificar casos
con resistencia a rifampicina entre los usuarios del Centro de Salud Jipijapa. La investigación
se sustenta en campos como bacteriologÃa, epidemiologÃa, salud pública y bioestadÃstica,

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disciplinas que entregan fundamentos cientÃficos necesarios para entender mejor la patologÃa
y mejorar tanto los procedimientos diagnósticos como los mecanismos de vigilancia en salud.
Marco teórico
La tuberculosis continúa siendo una enfermedad infecciosa de gran relevancia clÃnica y
epidemiológica, debido a su capacidad de transmisión por vÃa aérea, su evolución progresiva
y su impacto en poblaciones vulnerables. Su importancia no solo radica en la presencia de
casos activos, sino también en la posibilidad de desarrollar formas resistentes a los fármacos
de primera lÃnea. Por ello, el abordaje diagnóstico debe comprender tanto la identificación de
Mycobacterium tuberculosis como la detección temprana de resistencia a rifampicina, ya que
este antibiótico representa un componente esencial dentro del tratamiento antituberculoso.
En este sentido, la tuberculosis requiere métodos diagnósticos precisos, oportunos y
aplicables en los servicios de salud para reducir retrasos terapéuticos y limitar la transmisión
comunitaria (Baquero-Artigao et al., 2023).
Desde el punto de vista fisiopatológico, la infección por Mycobacterium tuberculosis inicia
cuando los bacilos son inhalados y alcanzan el parénquima pulmonar, donde interactúan con
los macrófagos alveolares. La capacidad del microorganismo para sobrevivir dentro de estas
células favorece su persistencia y permite la formación del granuloma tuberculoso. Este
proceso puede contener temporalmente la infección, pero también facilita la permanencia del
bacilo en estado latente durante largos periodos. Cuando las defensas del huésped
disminuyen, la enfermedad puede reactivarse y progresar hacia formas pulmonares activas,
con mayor carga bacilar y riesgo de contagio. Por esta razón, comprender la fisiopatologÃa de
la tuberculosis permite explicar la necesidad de pruebas diagnósticas que detecten el agente
etiológico antes de que se produzcan complicaciones clÃnicas y epidemiológicas (Hernández-
Solis et al., 2023).

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El diagnóstico de laboratorio constituye un componente fundamental para confirmar la
tuberculosis y orientar el tratamiento. Tradicionalmente, la baciloscopÃa ha sido empleada por
su accesibilidad, rapidez y bajo costo; sin embargo, presenta limitaciones en pacientes con
baja carga bacilar, coinfección por VIH, tuberculosis infantil o formas extrapulmonares. El
cultivo, por su parte, mantiene un alto valor diagnóstico debido a su sensibilidad, pero
requiere mayor tiempo para obtener resultados. Esta demora puede afectar la oportunidad
terapéutica, especialmente en pacientes que necesitan inicio inmediato de tratamiento. Por
ello, los métodos moleculares han adquirido importancia en el diagnóstico actual, al permitir
la identificación directa del material genético de Mycobacterium tuberculosis en muestras
clÃnicas (SÃmboli & González, 2022).
Dentro de los métodos diagnósticos, las pruebas moleculares representan un avance
significativo porque permiten detectar el ADN bacteriano en un menor tiempo y con mayor
precisión. Estas técnicas también aportan información relevante sobre genes asociados a
farmacorresistencia, como el gen rpoB, relacionado con resistencia a rifampicina. La
incorporación de pruebas moleculares en el laboratorio clÃnico fortalece la capacidad de
respuesta frente a la tuberculosis, debido a que permite diferenciar casos sensibles y
resistentes de forma temprana. Esto resulta especialmente importante en contextos donde el
retraso diagnóstico puede favorecer la transmisión de cepas resistentes y complicar el manejo
clÃnico del paciente (Tapia-Sequeiros et al., 2025).
El sistema GeneXpert MTB/RIF se ha consolidado como una herramienta diagnóstica de gran
utilidad porque integra en una sola plataforma la detección de Mycobacterium tuberculosis y
la identificación simultánea de resistencia a rifampicina. Esta prueba automatizada se basa en
la amplificación de ácidos nucleicos mediante PCR en tiempo real, lo que permite obtener
resultados en un tiempo aproximado de dos horas. A diferencia del cultivo, que puede requerir

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varias semanas, el GeneXpert ofrece una respuesta rápida que favorece la toma de decisiones
clÃnicas oportunas. Su uso es especialmente relevante en servicios de salud donde se requiere
confirmar la tuberculosis de forma temprana y reducir el riesgo de transmisión comunitaria
(Stevens et al., 2017).
Además de su rapidez, el GeneXpert MTB/RIF tiene valor epidemiológico porque permite
identificar mutaciones en la región rpoB, asociadas directamente con resistencia a rifampicina.
Esta caracterÃstica lo convierte en una prueba clave para la sospecha inicial de tuberculosis
multidrogorresistente, ya que la resistencia a rifampicina suele considerarse un marcador
importante de resistencia farmacológica compleja. Detectar esta alteración desde el inicio
permite evitar esquemas terapéuticos ineficaces, iniciar tratamientos adecuados y disminuir
la propagación de cepas resistentes. Por esta razón, su aplicación no solo beneficia al paciente
individual, sino también a los programas de vigilancia y control de tuberculosis (Blakemore et
al., 2010).
La sensibilidad y especificidad del GeneXpert MTB/RIF respaldan su utilidad dentro del
diagnóstico de tuberculosis. La sensibilidad permite identificar correctamente a los pacientes
que presentan la enfermedad, mientras que la especificidad permite descartar
adecuadamente a quienes no la padecen. En tuberculosis pulmonar, especialmente cuando
existe una carga bacilar suficiente, esta prueba ha mostrado un desempeño elevado; sin
embargo, su rendimiento puede variar en muestras paucibacilares o extrapulmonares. A pesar
de ello, continúa siendo una herramienta confiable para fortalecer el diagnóstico, sobre todo
cuando se interpreta en conjunto con la clÃnica, los antecedentes epidemiológicos y otros
resultados de laboratorio (Sharma et al., 2015).
En el ámbito clÃnico, GeneXpert MTB/RIF tiene múltiples aplicaciones. Su uso permite
confirmar tuberculosis pulmonar en pacientes sintomáticos respiratorios, apoyar el